히터뷰ㅣ 윤태영 프로티나 대표

PPI Landscape, 수천 개의 메이저 바카라 사이트 변이체를 평가해 메이저 바카라 사이트 최적화
PPI Pathfinder, 환자의 약물 반응을 사전에 정밀 메이저 바카라 사이트

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신약 개발 패러다임을 바꿀 새로운 기술이 등장했다. 단백질-단백질 상호작용(Protein-Protein Interaction, PPI)의 중요성이 커지면서, 이를 정량적으로 메이저 바카라 사이트하고 신약 개발에 활용할 수 있는 기술이 각광받고 있다. 기존에는 실험 시간이 길고 데이터 확보가 어려웠지만, 프로티나의 'SPID(Single-molecule Protein Interaction Detection)' 플랫폼이 이러한 한계를 뛰어넘으며 업계의 주목을 받고 있다.

프로티나에 따르면, SPID 플랫폼은 단일분자 수준까지 단백질 간 결합력을 정량적으로 분석하는 기술로, 정제과정 없이 PPI 분석이 가능하다. SPID 플랫폼을 활용하여 신약 후보 물질의 표적결합을 정량적으로 측정하고 최적 투여 용량을 확인할 수 있어 글로벌 제약사들은 이를 활용하여 보다 효율적인 임상을 진행할 수 있다. 또한, SPID플랫폼에 고속스크링 기능을 탑재하면서 메이저 바카라 사이트 개량 및 최적화 솔루션으로도 상용화했다. SPID 플랫폼이 어떻게 작동하며, 어떤 경쟁력을 가지고 있을까?<히트뉴스는윤태영 프로티나 대표를 직접 만나 메이저 바카라 사이트 플랫폼의 원리와 기술적 강점을 직접 들어봤다.

윤태영 프로티나 대표
윤태영 프로티나 대표

메이저 바카라 사이트 플랫폼, 단백질 간 상호작용 빅데이터로 신약 개발속도↑

PPI는 신약 개발에서 필수적으로 고려해야 할 요소다. 세포 내외부에서 생체 신호는 특정 단백질들이 결합해야만 정상적으로 전달된다. 윤태영 대표는 "예를 들어, 단백질이 결합하면서 phosphorylation(인산화)과 같은 여러 생화학적 변형을 유도할 수 있으며, 이를 통해 세포 분열이나 면역 반응과 같은 주요 생명 활동이 조절된다"며 "SPID 플랫폼은 이러한 단백질 간 상호작용을 정량적으로 메이저 바카라 사이트하여, 생체 내 신호 전달 과정을 보다 정밀하게 이해하는 데 기여할 수 있다"고 말했다.

신약 개발 과정에서 PPI 연구는, 단백질 간 결합의 이상 여부가 질환 발생과 밀접하게 연관되어 있고, 이를 조절하는 전략이 치료제 효능과 안정성을 높이는 핵심 요소 중 하나이기 때문에 중요하다. 윤 대표는 "많은 메이저 바카라 사이트 치료제나 단백질 기반 신약들이 특정 PPI를 조절하는 방식으로 작용하기 때문에, 이를 정량적으로분석하는 것이 중요하다"라며 "SPID 플랫폼은 신약개발 과정에서 임상용 검체 분석 뿐만 아니라, 대량의 항원-메이저 바카라 사이트 결합 데이터 생성을 통해 메이저 바카라 사이트 신약 개발을 위한 핵심 빅데이터를 쌓을 수 있는 플랫폼"이라고 설명했다.

SPID플랫폼은 프로티나가 10년 넘는 연구 끝에 자체개발한 범용 플랫폼 기술로 칩(Pi-Chip)과 장비(Pi-View) 부터 데이터 메이저 바카라 사이트 및 시각화 알고리즘까지 (Pi-Insight) 결합된 통합 플랫폼 기술이다.

윤 대표는 "칩에서 메이저 바카라 사이트과정이 시작되면, 연구자가 직접 데이터를 하나하나 메이저 바카라 사이트하는 것이 아니라, Pi-View 장비가 자동으로 이미지를 촬영하고 Pi-Insight가 형광 신호를 메이저 바카라 사이트해 결합력을 정량화한다"며, "이 시스템을 통해 연구자들은 물질의 결합력 변화를 보다 직관적으로 확인할 수 있다"고 말했다.

Pi view 장비로  / 사진=심예슬 기자
Pi view 장비로 메이저 바카라 사이트한 화면 / 사진=심예슬 기자

SPID 플랫폼은 칩 기반 실험, 데이터 분석, 시각화, AI 학습까지 하나의 프로세스로 연결된 통합 솔루션을 제공하며, 이를 통해 신약 개발 전주기에 걸쳐 효율성을 높이고 개발 기간을 획기적으로 단축할 수 있다. 해당 플랫폼은 'PPI Landscape' 솔루션을 활용해 메이저 바카라 사이트-항원 간 결합력을 최적화하고, 'PPI Pathfinder' 솔루션을 통해 신약 후보 물질 임상 검체 분석을 통해 표적결합과 최적 투여 용량을 정량적으로 분석할 수 있다.

두 솔루션의 차이는 사용하는 칩의 종류에 있다. PPI Landscape는 메이저 바카라 사이트 변이체의 결합력을 고속으로 평가할 수 있도록 설계된 384칩을 활용하며, PPI Pathfinder는 생체 내 단백질 복합체 형성을 정량적으로 분석할 수 있는 40칩을 기반으로 한다.

메이저 바카라 사이트 Pathfinder, 메이저 바카라 사이트 Landscape 개요 / 자료=프로티나
PPI Pathfinder, PPI Landscape 개요 / 자료=프로티나

PPI Pathfinder, 약물의 표적결합과 효능을 한눈에 파악하다

PPI Pathfinder는 환자에게서 채취한 검체를 PPI바이오마커를 통해 표적결합, 효능 및 최적 투여량까지 확인할 수 있는 솔루션이다. 신약 개발에서는 후보 물질이 목표 단백질과 얼마나 강하게 결합하는지를 평가하는 것만큼이나, 환자의 세포 내에서 실제로 해당 단백질을 조절하거나 분해하는지 확인하는 것이 필수적이다. 특히, 최근 단백질 분해 유도제(PROTAC) 및 이중 특이성 메이저 바카라 사이트(bispecific antibody)와 같이 복합적인 작용 기전을 가진 치료제들이 증가하면서, 단순한 결합력 분석을 넘어 단백질 복합체 형성 여부를 정밀하게 측정할 필요성이 더욱 커지고 있다.

윤태영 대표는 "PPI Pathfinder 솔루션은 특정 단백질 복합체의 양을 환자의 혈액이나 조직 등 다양한 임상 검체에서 정제 없이 단일분자 수준까지 측정하여 정량화 할 수 있는 기술"이라며, "이를 통해 약물의 효능과 최적 투여용량을 확인할 수 있다"고 말했다.

임상 검체 안에서 특정 단백질 복합체들의 양이 어떻게 변화하는 지를 정밀하게 추적하기 위해 개별분자 형광 이미징과 식별 알고리즘을 활용함으로써, 약물이 목표 단백질이나 항원을 성공적으로 타깃팅하고 있는지를 실험적으로 검증할 수 있다. 이를 메이저 바카라 사이트하면 신약의 작용 기전을 보다 명확하게 규명하는 데 도움을 준다는 것이 윤 대표의 설명이다.

프로티나는 급성골수성백혈병 (AML) 환자의 BCL2 표적저해제 (Venetoclax) 반응성을 사전에 예측할 수 있는 모델을 개발하여 해당 연구 결과를 2024년 Nature Biomedical Engineering지에 게재했다. 이를 계기로 미국 혈액암 학회(Leukiemia and Lymphoma Society, LLS)의 지원하에 에모리대학교 의과대학과 협력하여 예측 바이오마커의 글로벌 임상 검증을 진행 중이라고 밝혔다. 윤 대표는 "베네토클락스 (Venetoclax) 사용 환자를 위한 맞춤형 치료 진단제품(Dx)을 개발하는 것이 목표"라고 덧붙였다.

PPI Landscape, 메이저 바카라 사이트 최적화로빅 데이터로 기존의 한계를 넘다

메이저 바카라 사이트 플랫폼 개요 / 자료=프로티나
메이저 바카라 사이트 플랫폼 개요 / 자료=프로티나

PPI Landscape는 항원-메이저 바카라 사이트 결합력 측정 전 요구되는 정제 과정 없이, 세포 배양액에 분출된 극소량의 메이저 바카라 사이트 후보물질을 고속스크리닝 '파이칩(Pi-Chip)'으로 바로 전달하여 분석을 할 수 있으며, 메이저 바카라 사이트-항원 간 결합력 및 메이저 바카라 사이트 물성정보까지 분석이 가능한 솔루션이다. 이를 통해 결합력이 우수한 메이저 바카라 사이트 선별과 결합력을 높이는 선도물질 최적화 솔루션으로 활용이 가능하며, 현재 연구중인 국책과제가 완료되면 AI를 이용한 메이저 바카라 사이트 신약 설계도 가능해진다.

기존 메이저 바카라 사이트개량 방식에서는 단백질을 정제하고, 메이저 바카라 사이트 변이체를 제작한 후, 하나씩 평가하는 데까지 수개월이라는 시간이 소요됐다. 윤 대표에 따르면, SPID 플랫폼은 이러한 병목 현상을 해소하며, 단 2주 만에 수천 개의 변이체를 분석하고, 원본 메이저 바카라 사이트 대비 결합력이 향상된 최적의 메이저 바카라 사이트 서열을 도출할 수 있다. 그는 "기존에는 연구자들이 실험의 복잡성과 물리적 한계를 감수해야 했고, 이는 신약 후보 물질의 최적화 과정에서도 큰 제약이 되었다"고 말했다. 이어 "기존 SPR 기반 실험에서는 한 번에 약 20개의 변이체만 평가할 수 있었지만, SPID 플랫폼을 활용하면 매주 3000~5000개의 변이체 데이터를 확보할 수 있다"고 덧붙였다.

PPI Landscape의 핵심은 고속스크리닝이 가능한 384개의 측정구역(웰·well) 기반의 Pi-Chip을 활용해 변이된 메이저 바카라 사이트의 결합력을 대량으로 분석하는 방식이다. 연구진은 먼저 수천 개의메이저 바카라 사이트 변이체를 초소량 제작한 뒤, 여러 개의 파이칩(Pi-Chip)에 각각 분배하여 실험을 반복 수행하며 데이터를 축적한다.

윤 대표는 "실험 과정은 먼저 칩 표면에 메이저 바카라 사이트 변이체를 고정한 후, 칩을 세척하여 메이저 바카라 사이트만 남기고 항원을 주입하는 방식으로 진행된다"며, "메이저 바카라 사이트와 항원이 결합하면 형광 신호가 발생하며, 이를 통해 각 변이체의 결합력을 정량적으로 평가할 수 있다"고 설명했다.

PPI Landscape에서는 형광 점(fluorescent spot)의 개수를 기반으로 결합력을 정량적으로 측정하는 방식을 사용한다. 윤 대표는 "각 well에서 형광 신호의 세기와 형광 점의 개수를 비교하면 변이체별 결합력 차이를 평가할 수 있다"며, "원본 메이저 바카라 사이트보다 형광 점이 많고 신호 강도가 높다면 결합력이 향상된 것이고, 반대로 점이 줄어들면 결합력이 낮아진 것으로 판정할 수 있다"고 말했다.

SPID 플랫폼의 분석 장비인 Pi-View는 칩에서 형광 신호를 감지하여 메이저 바카라 사이트-항원 결합 반응을 실시간으로 시각화하며, Pi Insight 소프트웨어를 활용해 결합력의 정량적 데이터를 산출한다. 윤 대표는 "항원에는 일반적으로 EGFP(Enhanced Green Fluorescent Protein)가 결합돼 있어 결합 반응이 발생하면 형광 신호로 즉시 감지할 수 있다”며, “이 과정을 통해 연구진은 메이저 바카라 사이트 변이체별 결합력 변화를 시각적으로 확인하고, 최적 메이저 바카라 사이트 서열을 선별할 수 있다"고 말했다. "이러한 과정에서 결합력은 기존보다 10배 이상 향상되면서 서열상동성(sequence homology)은 50% 정도로 낮춘 사례도 확인된 바 있다"고 덧붙였다.

윤 대표는 "메이저 바카라 사이트 플랫폼의 강점은 빅데이터를 쌓기 위해 필수 조건인 실험을 반복해도 일관된 결과를 얻을 수 있도록 높은 안정성을 유지한다는 점"이라며, "만약 실험할 때마다 다른 결과가 나오면 이는 축적된 데이터의 신뢰성이 떨어져 빅데이터를 축적할 수 없지만, 메이저 바카라 사이트 플랫폼은 이러한 변수를 철저히 배제해 실험을 반복해도 동일한 데이터를 생성할 수 있어 빅데이터를 빠르게 쌓을 수 있다"고 강조했다.

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메이저 바카라 사이트 개발 서비스, 궁극적으로 AI 신약 설계까지 나아갈 것

PPI Landscape의 궁극적인 목표는 현재 진행중인 '인공지능 클라우드 메이저 바카라 사이트은행 구축'국책과제를 통해 AI 기반 메이저 바카라 사이트 설계 플랫폼 개발을 완성하는 것이다. 윤 대표는 "현재는 원본 메이저 바카라 사이트의 변이체를 최적화하는 서비스가 중심이지만, 향후에는 AI를 통해 메이저 바카라 사이트 설계까지 수행하는 단계로 발전할 것"이라며, "이를 위해 과제에서 개발하고 있는 AI와 프로티나의 빅데이터 생성을 접목시켜 50만 개의 데이터 포인트 학습을 목표이다. AI 기반 메이저 바카라 사이트 설계 기술은 올해 말 논문으로 공개될 예정"이라고 밝혔다.

이를 기반으로 향후 PPI Landscape를 AI 메이저 바카라 사이트 설계 플랫폼으로 확대하여 후보물질을 제약사 및 바이오기업에 라이선싱 아웃을 진행하는 전략을 목표로 하고 있다. 윤 대표는 "AI 메이저 바카라 사이트 설계 기술이 고도화되면, 신약 후보 물질 자체를 AI로 생성하고 라이선싱 아웃하는 모델로 확장할 계획"이라고 말했다.

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